Nach der Generalversammlung der Sportgemeinschaft Margetshöchheim 06 e. V. (SGM) ist der Verwaltungsrat die nächste Instanz im Verein. Der Verwaltungsrat, der vier bis fünf Mal im Jahr tagt, besteht aus dem Präsidium, den Abteilungsleitern, den Vorsitzenden und (maximal zwei pro Ausschuss) Stellvertretern von eventuell berufenen Ausschüssen, zwei Jugendvertretern (Alter zwischen 16 und 26 Jahren zum Zeitpunkt der Wahl), aus dem Sprecher des Ehrenrates sowie, wenn vorhanden, aus dem/der Geschäftsführer(in).
Hauptaufgaben des Verwaltungsrates sind die Zulassung, Auflösung oder der Erlass von Richtlinien für Abteilungen, die Genehmigung besonderer Geschäftsführungsmaßnahmen sowie von Rechtsgeschäften von über 5.000 € und unter 15.000 € sowie Aufsichtsaufgaben gegenüber Vorstand und Präsidium. Sitzungen des Verwaltungsrates finden auf Bedarf und Einladung des 1. Vorstandes beziehungsweise auf Antrag von einem Fünftel (1/5) der Mitglieder des Verwaltungsrates statt.